玩家在管理庇护所的过程中可能会遇到多种灾难，需要采取措施来应对和处理。应对这些灾难需要玩家具备合理的资源管理能力、战略思维和应急处理能力。合理安排庇护所内的设施和居民，制定应对策略，及时处理灾难，保护庇护所的居民和资源。通过合理的决策和行动，玩家可以让庇护所免受灾害的影响，维持良好的运转和生活环境。
游戏中可能会有外来势力或野生生物的袭击，对庇护所造成威胁。玩家需要组织居民进行防御，保护庇护所安全，在门口的位置设置高武力的居民镇守可以解决像强盗入侵或者是其他野生生物袭击的灾害。还有火灾，可能在庇护所内部的房间蔓延，会造成人员伤亡和资源损失。玩家可以安装灭火器设备或培养具备灭火技能的居民来应对火灾。
蟑螂会导致庇护所内部出现食物污染，如果解决得不及时还会有不同房间之间灾害蔓延的情况产生。影响居民的生活和健康，一些小孩和孕妇在遇到蔓延性灾害的时候还会乱窜甚至造成居民去世等严重的后果。玩家需要派遣居民进行清扫和治疗，以减轻虫患带来的影响，在每个可能有蟑螂入侵的房间都需要均匀分配一下高武力值的居民及时在问题苗头上麦那解决问题。
辐射灾害是玩家需要应对的一个重要问题。辐射会影响居民的健康，导致他们生病或死亡，因此玩家需要采取一些措施来应对辐射灾害。如果庇护所内有受辐射区域，可以封闭这些区域，不让居民进入。这样可以避免居民受到辐射影响，但同时也限制了区域的使用。在受辐射区域放置辐射减缓设备，如辐射净化器等。这些设备可以降低辐射水平，减少对居民的影响。 对于受到辐射的居民，可以派遣他们到医疗室接受治疗。医疗室设施可以提供治疗，帮助居民康复。可以建设防辐射设施，如辐射遮蔽室或辐射防护服。这些设施可以降低居民受到的辐射水平。如果辐射是由放射源泄漏引起的，需要及时修复泄漏源，防止辐射继续蔓延。如果庇护所内某个区域受到辐射影响，可以将那些受辐射区域的人员安排到其他区域工作，以降低他们的辐射接触。可以设置辐射检测设备，监测庇护所内的辐射水平。这样可以及时了解辐射情况，采取相应的措施。
