升级在各种游戏里都是非常重要的游戏内容，崩坏星穹铁道也不例外。玩家只有在提升开拓等级到一定程度之后才能进一步推进主线，而且开拓等级还能影响地图收益。成功突破之后，地图上拟造花萼或者侵蚀隧洞的产出以及怪物的掉落才会增加。
最好提升开拓等级的办法就是做主线，主线给予的经验值是最多的，而且主角的星魂也能够免费拿到。主线也能教会玩家一些基础的对战知识，这样后面的战斗也会更加轻松一些。而且游戏的主线还有不错的剧情可以欣赏，比如在黑塔空间站要打败袭击空间站的反物质军团，然后在第一颗遇到的行秋雅利洛VI号上回收星球上的星核等，后面还能登上中式赛博风格的仙舟舰船。
当前期主线做完之后可能会进入一段时间的长草期，但这个时候也是有很多方法可以继续升级的。最常见的就是每日任务，每天能完成的任务上限是6个，还能领到稀有的星穹奖励。而且任务难度也很低，登录就算完成一个，然后使用合成台去合成奇巧零食就能直接完成一个。剩下的任务也不用专门去做，在日常刷体力的时候就能顺便完成。每天使用体力就能拿到对应的经验值，而且体力会自然恢复，为了避免浪费也最好早点清理掉。这些方法升级的好处就是没有成本而且源源不断，但是缺点是速度比较慢。
在完成主线和日常之后，地图上还有很多角色支线可以去做。而且部分支线做起来也比较简单，没有太多的战斗元素，只要帮助艾丝妲站长跑跑腿或者调查一些奇异事件就行。再就是探索地图捡宝箱等，也是能够加快升级速度的。地图上有的宝箱需要解密才能打开，而有的需要战胜一些精英怪。但是两者难度都不算太高，普通智力和正常练度就能过。在探索过程中，有可能遇到黑色小猪一样的生物，它在游戏里叫做次元扑满。打败它之后能领到额外奖励，遇到了最好快点解决掉，不然两回合之后它就会逃跑。最后还是差一些等级的话，还可以利用背包里的燃料换取体力，一个相当于60点体力，主线以及大月卡界面都能领到。或者花费50星穹也能换到体力，只不这样做性价比不高。
