魂斗罗归来里面的金币获得方式很多，最主要的就是参与金币副本。在该玩法中，玩家需要尽量多打破一些装着金币的木桶和掉落金币的首领，结算时将根据击破的桶和首领残余多少血量来决定最终的金币奖励。金币本每天能够玩两次，两次用完只能等次日任务更新再行参与，打完后游戏会给出一个评分，分数达到3s时就能开启扫荡功能，每天来扫荡一下就能拿到金币奖励了。注意金币本有三种难度，木桶和首领的血量都是随难度更新的，不过难度提高只会加厚木桶的血量不会加快桶的移动速度。
日常是大部分游戏都会设置的一个功能，魂斗罗里面也有，玩家每天上线做完当日日常后就积累一些经验值和活跃度。而活跃度是积分制的，活跃度达到定好的档位后就会掉落箱子，开活跃箱子也能拿金币。游戏中设定了很多关卡，玩家每通过一个关卡就会获得评分，要是最终评分达到的满星要求积累了一定数量的星星后就会获得箱子奖励，开关卡箱子也能拿到进步。成就点数是获取奖励的关键，玩家每做完一个成就任务就可以奖励，这些奖励中就包含了金币奖励。
等级到位后会开放军团功能，加入军团即可拿到军团管理员发放的福利。而进了军团能够拿到的奖励种类很多，包括金币、钻石和神秘包奖励，一般只要每天登陆就可以拿到金币了。玩家能够拿到的军团福利与军团福利中心等级有关，福利中心等级足够就能给军团成员发放大量金币奖励。最后一种是直接用钻石买，这也是收集金币的最快方法。不过每天能换的金币次数有限，想要增加兑换次数需要氪金，随着氪金数额的增加，玩家每天能够消耗的次数也会变多的。
